Lázně Toušeň leží na křižovatce cyklistických stezek č. 241 a 0019 (na některých mapách též značena jako 7019). Páteřní trasa č. 241 vedoucí z Prahy - Černého Mostu (přes Benátky nad Jizerou, Mladou Boleslav, Jablonné v Podještědí) na sever až na státní hranici přechází Labe po lávce právě v Lázních Toušeni. Kratší cyklostezka č. 0019 vede po levém břehu Labe z Brandýsa nad Labem (přes Čelákovice, Sedlčánky) do Přerova nad Labem.